Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED8Q96G25 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED8Q96G25 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms