Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PHF21BQ96EK2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF21BQ96EK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms