Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGBD4Q96DM1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms