Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX58Q96C10 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms