Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD8

SKA1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA1Q96BD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKA1Q96BD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms