Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms