Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms