Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSC1Q92574 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms