Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms