Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO7Q8WWI1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms