Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSMEM1Q8WWF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSMEM1Q8WWF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms