Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWA1

TMEM40, Transmembrane protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM40Q8WWA1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM40Q8WWA1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM40Q8WWA1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms