Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC4Q8WW27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC4Q8WW27 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms