Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf3Q8WVX3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf3Q8WVX3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms