Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms