Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX54Q8TDD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms