Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNERQ8NFT8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNERQ8NFT8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms