Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF214Q8ND24 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF214Q8ND24 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms