Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 415.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-215ENST00000549983 860 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KMT5C-206ENST00000468951 661 ntTSL 315.46■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-210ENST00000617369 531 ntTSL 315.43■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 315.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIRT6-204ENST00000594341 371 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MICAL3-205ENST00000424046 542 ntTSL 415.36■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ASF1B-204ENST00000590835 746 ntTSL 515.33■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 415.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KMT5C-204ENST00000460956 637 ntTSL 515.28■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-220ENST00000552876 2016 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENTPD6-218ENST00000490187 1918 ntTSL 215.17■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-207ENST00000495048 592 ntTSL 215.15■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-211ENST00000512449 832 ntTSL 515.1■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-214ENST00000622231 367 ntTSL 515.1■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIRT6-205ENST00000595670 1057 ntTSL 515.03■□□□□ -05e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 515.02■□□□□ -05e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RIMKLB-209ENST00000539923 481 ntTSL 415.02■□□□□ -05e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 515.01□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHYKPL-206ENST00000476487 2251 ntTSL 215□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-215ENST00000559811 414 ntTSL 314.96□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-210ENST00000533771 581 ntTSL 314.89□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-212ENST00000557763 933 ntTSL 514.88□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-213ENST00000621664 471 ntTSL 214.8□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 514.77□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 214.72□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-209ENST00000520895 551 ntTSL 414.68□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NSL1-205ENST00000487995 685 ntTSL 214.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPG7-203ENST00000561702 2042 ntTSL 214.59□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 414.59□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 314.58□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 214.52□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-208ENST00000527187 1441 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TXNRD2-210ENST00000475995 751 ntTSL 514.51□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-210ENST00000436637 765 ntTSL 314.51□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 414.5□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHGDH-233ENST00000642021 2794 nt14.43□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHYKPL-207ENST00000481436 2025 ntTSL 214.41□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 81.8
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SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-9■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 214.3□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-207ENST00000490457 916 ntTSL 314.28□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.21□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 314.16□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-203ENST00000417173 1215 ntTSL 214.09□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-205ENST00000553494 717 ntTSL 314.08□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.08□□□□□ -0.165e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LTBP3-206ENST00000526825 1002 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIRT6-208ENST00000597896 827 ntTSL 314□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.81□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 213.78□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 81.8
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