Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms