Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMNTD2Q8IXW0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMNTD2Q8IXW0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms