Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC65Q8IXS2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC65Q8IXS2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms