Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN4BQ8IWT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN4BQ8IWT1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms