Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKL3Q8IVW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms