Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VPS37DQ86XT2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37DQ86XT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms