Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC84Q86UT8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms