Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3Q7Z3Z2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms