Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDXQ7Z353 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms