Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CATSPER4Q7RTX7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms