Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms