Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZD4Q76G19 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms