Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q71RC1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q71RC1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q71RC1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q71RC1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q71RC1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms