Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYDE1Q6ZW31 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms