Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms