Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NFXL1Q6ZNB6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFXL1Q6ZNB6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms