Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZRN4Q6ZMN7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms