Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCBE1Q6UXH8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms