Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSTM1Q6UX27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms