Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRSAM1Q6UWE0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRSAM1Q6UWE0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms