Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF7Q6Q0C0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF7Q6Q0C0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms