Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC137Q6PK04 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms