Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms