Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXS1

PPP1R2P3, Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R2P3Q6NXS1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1R2P3Q6NXS1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R2P3Q6NXS1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms