Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3HQ6NTF7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms