Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SUMO4Q6EEV6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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