Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGALS9CQ6DKI2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms