Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC102BQ68D86 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC102BQ68D86 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms