Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L1Q676U5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms