Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGNBP1Q5YKI7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGNBP1Q5YKI7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms