Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms